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Eric Jacobson começou a trabalhar com os Muppets em 1994 como marionetista na Vila Sésamo, e subiu nas fileiras de marionetistas. Para manter os personagens de Frank Oz - que estava se concentrando mais em direção e outras atividades - vivos e visíveis, Jacobson foi selecionado devido ao seu forte talento como marionetista e alcance vocal muito semelhante. Jacobson trabalhou em projetos estrelados pelos clássicos personagens Muppet Show e Sesame Street, e em O Urso na Casa Azul.
Jacobson é atualmente o artista principal de Fozzie, Miss Piggy, Animal e Sam - como Frank Oz havia se aposentado como artista em 2000.
Na convenção de fãs do MuppetFest em 2001, Jacobson fez sua estréia dos Muppets apresentando secretamente Miss Piggy dando as boas-vindas aos fãs "ao vivo via satélite". Jacobson fez sua primeira grande estréia na produção dos Muppets, interpretando Fozzie, Miss Piggy e Animal em It's a Very Merry Muppet Christmas Movie de 2002. Ele assumiu o papel de Sam a partir de 2005 com Os Muppets e o Mágico de Oz.
Fora de Henson, Jacobson trabalhou no The Puzzle Place, no Jack's Big Music Show e no The Book of Pooh da Disney (além de um programa de TV chamado Once Upon a Tree, no qual ele interpretou Billy Bob). Ele também se apresentou no palco realizando teatro de marionetes ao vivo na cidade de Nova York com a The Puppet Company, o Cosmic Bicycle Theatre e o Swedish Cottage Marionette Theatre no Central Park.